No, perchè quel EXE incormpora il file JAR. Richiama il Runtime ed esegue il JAR incorporato.
Stessa cosa che faresti con un file BATCH (.BAT) ma lo fai con un EXE
Come sai l'EXE ha un HEADER, il codice e una zona dati. Praticamente il codice é sempre lo stesso, che richiama il runtime di java. I dati contengono il JAR. Viene modificato l'HEADER per avere il controllo della parità corretto per la lunghezza dei dati e per il controllo dell'integrità del file