Se lo desideri puoi anche installare in un diverso folder e quindi avere entrambe le versioni disponibili.
Per darti un'idea, io uso uno schema tipo il seguente
C: \Programmi (x86)\Anywhere Software
----B4A
------B4A880
------B4A900
------B4A1000
------B4A1002
----BJ
------B4J731
------B4J850
Nel mio caso la "scocciatura" sta nell'aggiornare il set di regole del firewall, ma quasi mai adotto le nuove versioni appena vengono rese disponibili, quindi non è un'operazione così frequente..